La Scuola Domenicale costituisce per la chiesa Emmanuel una sezione vitale per quel che concerne i compiti dell'insegnamento biblico.

Il termine "Scuola Domenicale" ci riporta indietro di secoli quando, nel lontano 1780, Robert Raikes, di professione editore di un giornale di Gloucester (una città dell'Inghilterra) decise di fare qualcosa per arginare la criminalità e la povertà esistente nel suo paese. Indirizzando i suoi sforzi verso i ragazzi della città che vivevano in uno stato di totale abbandono sociale e morale, riuscì ad organizzare delle lezioni scolastiche. Il giorno scelto per gli incontri fu la domenica, perché era l'unico giorno libero dei ragazzi che, durante gli altri giorni, erano sottoposti a lavori pesanti e crudeli. Sorse la "Scuola Domenicale" dove gli adolescenti potevano imparare a leggere ed a scrivere attraverso l'insegnamento impartito da maestri sostenuti da Robert Raikes. Successivamente i ragazzi furono condotti nelle chiese locali e quindi istruiti nella conoscenza degli insegnamenti della Bibbia.

La Scuola Domenicale della Chiesa Emmanuel è pensata non solo per i bambini e gli adolescenti, ma per tutte le età. Difatti, l'ultima delle cinque classi di insegnamento esistenti, è frequentata dagli adulti (dai 24 anni in poi).

Gli incontri sono diretti dai monitori, insegnanti appartenenti alla comunità, che hanno il compito di spiegare gli insegnamenti tratti dalla Parola di Dio. I monitori traggono il materiale per la lezione direttamente dalla Bibbia, integrandola con testi e pubblicazioni studiati appositamente per la Scuola Domenicale. Nelle prime due classi (età compresa tra i 4 e i 9 anni), parallelamente alla lettura di testi si svolgono attività ludiche elementari (disegni, scenette, giochi, canto), studiati per rendere più divertente e meno faticoso l'apprendimento.

Nell'anno accademico 2009-2010, gli iscritti che frequentano con regolarità la Scuola Domenicale sono circa 90, mentre il corpo insegnanti è composto da 13 monitori/trici.